- Giúp Bộ trưởng phụ trách các lĩnh vực: Nghiên cứu khoa học.
- Giúp Bộ trưởng phụ trách công tác: Hợp tác quốc tế, hội nhập kinh tế quốc tế, mạng lưới các cơ quan đại diện khoa học và công nghệ ở nước ngoài; Quy hoạch, chiến lược phát triển ngành Khoa học và Công nghệ.
- Theo dõi và chỉ đạo các đơn vị: Vụ Hợp tác Quốc tế; Vụ Pháp chế (Thứ trưởng phụ trách hoạt động hành chính của Vụ); Vụ Khoa học Xã hội, Nhân văn và Tự nhiên; Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam - Hàn Quốc; Học viện Chiến lược Khoa học và Công nghệ.