- Giúp Bộ trưởng chỉ đạo các lĩnh vực: Ứng dụng công nghệ, đổi mới sáng tạo, khởi nghiệp và doanh nghiệp khoa học và công nghệ; Sở hữu trí tuệ.
- Giúp Bộ trưởng phụ trách công tác: Đào tạo, bồi dưỡng, phát triển nguồn nhân lực.
- Theo dõi và chỉ đạo các đơn vị: Cục Sở hữu trí tuệ; Cục Khởi nghiệp và Doanh nghiệp công nghệ; Cục Đổi mới sáng tạo; Vụ Đánh giá và Thẩm định công nghệ; Quỹ Đổi mới công nghệ quốc gia; Viện Khoa học sở hữu trí tuệ; Viện Ứng dụng công nghệ; Viện Nghiên cứu và Phát triển vùng; Viện Nghiên cứu sáng chế và Khai thác công nghệ; Học viện Công nghệ Bưu chính Viễn thông; Trường Cao đẳng Thông tin và Truyền thông.