Theo Thông tư, việc đánh giá tạp chí khoa học phải bảo đảm tính khoa học, khách quan, minh bạch và công bằng trong suốt quá trình. Hệ thống tiêu chí được xây dựng dựa trên Điều 36 Nghị định 262/2025/NĐ-CP của Chính phủ về thông tin, thống kê, chuyển đổi số và đánh giá trong lĩnh vực khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo. Việc đánh giá, xếp loại được thực hiện hằng năm, đồng thời có thể tiến hành đột xuất theo yêu cầu của cơ quan quản lý.
Việc đánh giá, xếp loại tạp chí khoa học phải bảo đảm tính khoa học, khách quan, minh bạch và công bằng.
Bộ tiêu chí gồm 100 điểm, trong đó nội dung học thuật được xem là nền tảng quan trọng nhất. Một tạp chí phải bảo đảm trên 75% số bài đăng là nghiên cứu học thuật, bài tổng quan hay phản biện khoa học, đồng thời sử dụng chuẩn trích dẫn quốc tế và công bố đầy đủ tiêu đề, tóm tắt, từ khóa bằng tiếng Anh. Hội đồng biên tập cũng được đánh giá chặt chẽ, yêu cầu tối thiểu 50% thành viên là chuyên gia độc lập ngoài cơ quan chủ quản, có trình độ phù hợp và công khai danh sách trên website; sự tham gia của chuyên gia quốc tế được tính điểm khuyến khích.
Quy trình bình duyệt bài là một trong những tiêu chí trọng yếu, đòi hỏi tạp chí phải công bố minh bạch quy trình tiếp nhận, phản biện và biên tập; công khai chính sách thu phí hoặc miễn phí; áp dụng cơ chế phản biện kín với ít nhất hai phản biện độc lập cho mỗi bài. Bên cạnh đó, các chuẩn mực xuất bản khoa học như xuất bản đúng kỳ, có mã ISSN hợp lệ, cùng các chính sách chống đạo văn, rút bài, bảo vệ bản quyền và xử lý xung đột lợi ích cũng được xem là yêu cầu bắt buộc.
Thống kê số bài báo và trích dẫn theo năm.
Thông tư cũng nhấn mạnh yếu tố minh bạch và khả năng truy cập. Website của tạp chí phải cập nhật đầy đủ tôn chỉ hoạt động, Hội đồng biên tập, quy định nộp bài và hướng dẫn tác giả. Các bài báo phải được đăng tải toàn văn kèm tóm tắt, từ khóa và mã DOI nếu có. Đặc biệt, một tạp chí chỉ được xếp loại đạt chuẩn khoa học nếu được chỉ mục trên Hệ thống thông tin quốc gia về khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo hoặc trên các cơ sở dữ liệu quốc tế như Scopus hay Web of Science.
Một tạp chí được công nhận đạt tiêu chuẩn khi đạt từ 75 điểm trở lên và đồng thời đáp ứng đầy đủ ba nhóm tiêu chí quan trọng gồm nội dung học thuật, quy trình bình duyệt và chỉ mục khoa học. Với việc ban hành Thông tư 27, Bộ KH&CN kỳ vọng hệ thống tạp chí khoa học Việt Nam sẽ được chuẩn hóa theo thông lệ quốc tế, góp phần nâng cao chất lượng nghiên cứu, thúc đẩy đổi mới sáng tạo và tăng cường vị thế của các công trình khoa học Việt Nam trên bản đồ tri thức thế giới.
